基于定性PCR法的转基因食品分析步骤实例如图1所示。粉碎样品后，使用提取套件等提取DNA。使用生命科学紫外可见分光光度计BioSpec-nano测出提取DNA的DNA浓度，将所定量的提取DNA作为模板进行PCR。

使用微芯片电泳装置MCE-202“MultiNA”进行PCR产物的电泳分析，确认有无对应目标基因序列的PCR产物。

定性PCR法的分析灵敏度非常高，因此，可以检测到提取DNA中含有的微量转基因。分别生产流通管理中对于非转基因体的转基因体混入率的容许值为5％，但即使混入率在5％以下也常常使用定性PCR法检测转基因。以定性PCR进行转基因检测时，进一步使用定量PCR法求出混入率。定量PCR法将从样品提取的DNA作为模板，使用用于检测转基因以及内在性基因的引物实施PCR。

基于定量PCR扩增曲线的解析，求出提取DNA所含转基因以及内在性基因的数目（复制数）。式1、式2分别定义混入率（％）、内标比。表示其实施了分别生产流通管理的「分离非转基因的」或「非转基因」的食品，但其转基因体混入率超过5％时，需要审查分别生产流通管理的内容。并且，加工食品中，转基因与内在性基因的分解率不一定一致，因此不能准确求出混入率。

混入率（％）=｛（转基因的复制数） / （内在性基因的复制数）｝×（1 / 内标比）×100   （式1）
内标比 =（纯粹的转基因农作物中的转基因数） / （纯粹的转基因农作物中的内在性基因数）   （式2）
 

［参考资料］
农林水产消费安全技术中心,JAS分析试验手册「转基因食品检查·分析手册」,
http://www.famic.go.jp/technical_information/jashandbook/index.html