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生物标记物发现 | SNP分型

2020-12-23

SNP分型


基于使用基因扩增试剂的血液直接PCR法与电泳法的耐药性基因SNP分型例

根据基因信息预测药物效果及副作用的研究称为药物基因组学(PGx)。特别是基因组序列中的单核苷酸多态性(SNPs)有望作为PGx生物标记物,在抗癌剂等的药物疗效·副作用预测、适于每个不同患者的给药,也就是所谓的个性化医疗领域的应用研究正取得进展。

介绍SNP分型例。

ABCC11基因(耐药性基因)是ATP结合性盒转运体基因群之一,是局部存在于细胞膜等的中耐药性基因,具有将细胞内物质排出至细胞外的功能。

这是基于使用基因扩增用试剂 Ampdirect Plus的血液直接PCR法,使用DNA/RNA分析用微芯片电泳装置判定该基因的SNP分型的结果。

基于MultiNA的ABCC11基因的SNP分型例(凝胶图)


本方法不同于传统方法(PCR-RFLP,在PCR扩增后,通过限制性内切酶处理进行序列特异性断链反应,检测所产生的DNA片段尺寸),只需在单管中实施一次PCR反应和泳动分析即可完成SNP分型,作为简便且经济的SNPs分型法,适于多检体解析。