药物研发，识别出多种盐的形式从而改变作为药物的活性药物成分（API）的性质，并且在选择药物化合物的离子（反）方面越来越受到关注。在医疗中所使用的一半药物分子都是以盐的形式存在的离子化合物。反离子的不同可改变物理化学性质（可溶性，结晶性，吸湿性）以及药物动力学性质（生物利用度，剂型）。在药物研发过程中，评估多种反离子可以更好的控制这些性质。

离子色谱（IC）和毛细管电泳通常用来分析这些反离子。

以下介绍了通过高性能液相色谱仪（HPLC）以及离子色谱（IC）对药物中阴阳反离子的分析。